Sie müssen alle Dateien, die Sie auf Ihrer Webseite verfügbar machen wollen in das Verzeichnis /web/ (=document root) hochladen. Bei Subodmains (vHost) ist der Ordner entscheidend, den Sie bei Basisordner angegeben haben.
Zum Hochladen benutzen Sie am besten einen FTP-Client, wie z.B. den kostenlosen Filezilla. Diesen erhalten Sie hier